Силиконовите катетри се използват широко в клиничната медицина, предимно за случаи на затруднено уриниране, задържане на урина или постоперативна катетеризация. Временната катетеризация е подходяща при пациенти с остра задръжка на урина. При асептични условия катетърът се вкарва през уретрата в пикочния мехур, за да подпомогне бързото изтичане на урината; времето за катетеризация обикновено не надвишава 24 часа. Постоянната катетеризация се използва при пациенти с дълготрайни уринарни нарушения, като неврогенен пикочен мехур или напреднала доброкачествена хиперплазия на простатата. За закрепването му в пикочния мехур се използва силиконов катетър с балон, което изисква ежедневно почистване на уретралния отвор и редовна смяна на торбичката за събиране на урина.
Промиването на пикочния мехур включва инжектиране на лекарства като физиологичен разтвор или антибиотични разтвори в пикочния мехур през катетър за лечение на цистит или предотвратяване на блокиране на кръвен съсирек. Процедурата изисква ниско-налягане, бавно напояване и стриктна асептична техника. Уретралната дилатация се използва при пациенти със стриктура на уретрата, постепенно увеличаване на диаметъра на катетъра за подобряване на уринирането; това трябва да се извърши от квалифициран лекар. Следоперативният дренаж е често срещан след урологична операция. Използва се катетър за проследяване на отделянето на урина и намаляване на налягането в пикочния мехур; дренажната система трябва да се държи затворена. Силиконовите катетри имат гладка повърхност, добра биосъвместимост и слабо дразнене на уретралната лигавица, което ги прави подходящи за дългосрочна постоянна катетеризация.
